截至2月10日，共有55份新型冠狀病毒基因組數(shù)據(jù)可公開獲取。其中1月22日以前獲取的31份測(cè)序數(shù)據(jù)幾乎全部來自中國(guó)（僅有1例來自美國(guó)）。然而1月22日以后，余下的24份數(shù)據(jù)一律來自國(guó)外，包括日本、韓國(guó)、新加坡、澳大利亞、美國(guó)、法國(guó)、英國(guó)等。

　　“數(shù)據(jù)背景的斷層，使我們很難在時(shí)間與地理上找到連續(xù)的規(guī)律。數(shù)據(jù)不規(guī)范公開的趨勢(shì)彰顯了學(xué)術(shù)界的矛盾。”

　　2月18日，中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授、臺(tái)灣“中研院”院士吳仲義和中國(guó)科學(xué)院院士、中科院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心（神經(jīng)科學(xué)研究所）學(xué)術(shù)主任蒲慕明，在《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》上再次撰文指出，在當(dāng)前的危急情形下，科學(xué)家扣留數(shù)據(jù)的影響會(huì)是嚴(yán)重而深遠(yuǎn)的。他們呼吁國(guó)內(nèi)學(xué)者即時(shí)公布和共享新型冠狀病毒測(cè)序數(shù)據(jù)。

　　兩周前，兩人曾在《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》撰文呼吁將新冠病毒的基因組數(shù)據(jù)盡快公開。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：為什么關(guān)心新型冠狀病毒的基因測(cè)序數(shù)據(jù)？

　　吳仲義：目前，新型冠狀病毒可能已經(jīng)達(dá)到頂峰，不會(huì)再進(jìn)化；但也可能蓄勢(shì)待發(fā)，進(jìn)入危險(xiǎn)期。在兩極分化的不確定下，只有公開數(shù)據(jù)，才能讓科學(xué)家知道下一步怎么走。

　　病毒感染人群后可能會(huì)發(fā)生快速演變，而自然選擇偏好高傳染力的突變。17年前SARS的暴發(fā)也體現(xiàn)出這樣的傳播規(guī)律：2002年11月至2003年1月底，SARS病毒的傳播速度較為緩慢，2003年2月起開始迅速加快，這種趨勢(shì)一直延續(xù)至疫情晚期。

　　傳播加速與病毒RNA序列的改變息息相關(guān)；尤其是病毒S蛋白在傳播前期快速積累了5個(gè)氨基酸突變。這說明SARS病毒從果子貍躍染到人之后，經(jīng)歷了一系列遺傳適應(yīng)性改變。

　　目前我們已經(jīng)看到，兩場(chǎng)流行病的特征有諸多不同，但這大多是臨床分析上的。如果能盡快獲得病毒基因組數(shù)據(jù)，就可以通過對(duì)比兩種病毒進(jìn)化動(dòng)態(tài)的差異，更準(zhǔn)確地判斷疫情，也更精準(zhǔn)地進(jìn)行防控。

　　蒲慕明：作為科研人員，在很急切地尋找基礎(chǔ)數(shù)據(jù)、想研究這個(gè)病毒到底有沒有變異時(shí)，我們卻發(fā)現(xiàn)，很難找到較新的國(guó)內(nèi)研究數(shù)據(jù)。這很不正常，因?yàn)閲?guó)內(nèi)有更多的病毒材料，也掌握了更多的相關(guān)數(shù)據(jù)，能開展測(cè)序工作的科研人員也并不少。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：如果貽誤了對(duì)病毒序列變異的掌握，會(huì)對(duì)我們的防疫工作造成哪些實(shí)際的威脅和阻礙？

　　蒲慕明：病毒在人身上傳播，肯定會(huì)發(fā)生變化。它的傳染力和毒性是變得更強(qiáng)還是更弱了？我們要掌握這些信息，才能有更好的對(duì)策。

　　而且，新型冠狀病毒的感染范圍已經(jīng)遍及全國(guó)絕大多數(shù)地區(qū)，不同地區(qū)的病毒可能已經(jīng)出現(xiàn)演化上的差異。不知道這些差異，也不知道變異的過程，我們就很難精準(zhǔn)地、因地制宜地進(jìn)行防疫。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：近期有部分論文指出，迄今病毒樣本之間的全長(zhǎng)基因組序列幾乎完全相同，提示病毒未發(fā)生明顯的變異。如何看待這樣的結(jié)論？

　　吳仲義：沒看到變異，甚至還沒有仔細(xì)看，不能就說沒有變異。

　　人與黑猩猩基因組序列僅有1.2%的差別。但是這一點(diǎn)差異非同小可。如果要說人與黑猩猩之間“未發(fā)現(xiàn)明顯的變異”，那似乎有點(diǎn)違背常情。

　　蒲慕明：還是要拿測(cè)序數(shù)據(jù)說話，而且是即時(shí)更新的數(shù)據(jù)，而不是較早發(fā)布的數(shù)據(jù)。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：1月22日以前獲取的31份測(cè)序數(shù)據(jù)幾乎全部來自于中國(guó)；然而1月22日以后，余下的24份數(shù)據(jù)一律來自國(guó)外——1月22日這個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)可能意味著什么？

　　蒲慕明：這個(gè)我們也不清楚。

　　吳仲義：這是一個(gè)趨勢(shì)。時(shí)間節(jié)點(diǎn)具體發(fā)生在哪天，或許關(guān)系不大。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：國(guó)內(nèi)哪些機(jī)構(gòu)能獲得新型冠狀病毒基因組的最新序列數(shù)據(jù)？

　　蒲慕明：很多地方能做，要求就是第一能拿到病毒，第二具備有資質(zhì)的病毒實(shí)驗(yàn)室。理論上1月22日以前發(fā)表序列的這些機(jī)構(gòu)都能做。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：你們提到，需要警惕位于病毒ORF8基因中28144位點(diǎn)上的突變—— 在1月5日以前于武漢采集的13例樣本中只出現(xiàn)了1次（7.8%），但在1月10日之后于武漢之外采集的42例樣本中，出現(xiàn)了18次（43%）。這個(gè)位點(diǎn)的突變可能意味著什么？

　　蒲慕明：這可能是一個(gè)毒性相關(guān)位點(diǎn)。但要判斷新型冠狀病毒的毒性是不是發(fā)生了變異，我們還需要更多資料。

　　吳仲義：從進(jìn)化角度，這個(gè)突變的傳播速度似乎不尋常。但樣本數(shù)量不夠大，統(tǒng)計(jì)學(xué)上未必可靠。我們需要更多的數(shù)據(jù)來查清楚這個(gè)突變是否是個(gè)危險(xiǎn)訊號(hào)。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：如此重要的測(cè)序數(shù)據(jù)，在公共平臺(tái)上卻難以查找，這是什么原因?qū)е碌模?/p>

　　吳仲義：數(shù)據(jù)是有的，為何不發(fā)我們不知道。

　　蒲慕明：我們國(guó)內(nèi)沒有一個(gè)公開的地方可以去查這些數(shù)據(jù)，這的確很奇怪。我們只能推測(cè)有可能是科研人員希望用這些數(shù)據(jù)去寫論文，發(fā)表在高影響因子的期刊上。

　　《中國(guó)科學(xué)報(bào)》：如果真是這樣，那是違背學(xué)術(shù)道德和科研倫理的吧？

　　蒲慕明：鑒于當(dāng)前疫情的嚴(yán)峻形勢(shì)，是這樣的。

　　因此我們建議采用“胡蘿卜加大棒”的方式促進(jìn)數(shù)據(jù)的發(fā)表。所謂“胡蘿卜”，就是建議期刊接收發(fā)表初步處理的基因組學(xué)數(shù)據(jù)。即便沒有新的數(shù)據(jù)產(chǎn)出，基于先期數(shù)據(jù)完善的分析結(jié)果也應(yīng)該接收。

　　所謂“大棒”，就是期刊應(yīng)當(dāng)對(duì)那些隱瞞公共衛(wèi)生安全數(shù)據(jù)的論文嚴(yán)肅對(duì)待，拒絕發(fā)表這種基于不道德學(xué)術(shù)行為的研究。

　　應(yīng)對(duì)數(shù)據(jù)發(fā)布，國(guó)內(nèi)已經(jīng)建立了一些開放數(shù)據(jù)庫（例如https://bigd.big.ac.cn/，https://db.cngb.org），或開放數(shù)據(jù)分析平臺(tái)（例如https://fight-sars2.genowis.com) 。

　　現(xiàn)在不要求你寫大文章，也不要求你的寫作符合高水平期刊的要求，請(qǐng)大家把數(shù)據(jù)即時(shí)共享到開放平臺(tái)上！

　　相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa030